Minētais projekts guva lielu sabiedrības interesi un atsaucību, un pēc veiksmīgās izstādes NOASAM radās ideja, uz iegūto A.Skrastiņa darbu pamata, sākt veidot plašāku Naivās mākslas kolekciju, tās izveidei lielu ieguldījumu ir devis mākslas zinātnieks Aivars Leitis.
Pateicoties SIA „Jaunrīgas attīstības uzņēmuma” atbalstam 2006.gada rudenī Andrejsalā, bijušajā muitas noliktavas ēkā, tika izveidots Latvijas Naivās mākslas muzejs. Veiksmīgās sadarbības rezultātā 20. maijā, Muzeju nakts laikā, tas pirmo reizi vēra savas durvis apmeklētājiem. Muzeja atklāšana, kurā svinīgu uzrunu teica kultūras ministre Helēna Demakova, kļuva par vienu no vakara spilgtākajiem notikumiem.
2006.gada vasaras sezonā muzejs ar vairākām interesantām ekspozīcijām sevi veiksmīgi pieteica Rīgas iedzīvotājiem un viesiem un guva lielu sabiedrības atsaucību, tādēļ jau 2007.gada 6.jūnijā Latvijas Naivās mākslas muzejs saņēma muzeja akreditācijas apliecību (ar zīmīgo Nr. 99) un tika iekļauts Latvijas akreditēto muzeju sarakstā. Akreditācija ir piešķirta uz pieciem gadiem, tas ir, līdz 2012.gada 5.jūnijam.
Līdz šim muzeja krājums ir veidojies no dāvinājumiem un privātām kolekcijām, kas ir nodotas muzejam glabāšanā uz nenoteiktu laiku, bet daļa darbu ir iegūti pirkumu ceļā. Šobrīd pamata krājumā, kas ir iekļauts arī Latvijas nacionālajā krājumā, atrodas 179 naivās mākslas meistardarbi, bet palīg krājumā vairāk kā 900 darbu un fotoreprodukciju. Pastāvīgi notiek arī Muzeja krājuma papildināšana un tiek apzināti aizvien jauni un jauni naivās mākslas autori un to darbi.
