1992 antogs Rigas zoo i Europas Zoo- och akvarieförbund (EAZA) och den 22 december beslutade Republiken Lettlands styrande råd att Rigas zoo skulle få status som nationellt zoo.
1993 grundades "Cīruļi", som är zooets bas utanför staden. Målet var att skapa plats åt och avla kianger. 1997 blev insektshuset en permanent avdelning.
I Rigas zoo finns också en resande utställning som heter de små jättarna. Rörliga dockor återspeglar mångfaldigt uppförstorade insekter. Utställningen inkluderar också levande djur och kunskapsspel.
Den 13 november 1998 invigdes WHISKAS tigerhus – den största och modernaste byggnaden av sådan typ i Europa. Detta var den första byggnaden som uppförts på zooets territorium sedan 1930-talet. Den byggdes med hjälp av donerade pengar (både från företag och privatpersoner), och de största finansiärerna var Lettlands miljöskyddsfond och företaget MasterFoods. 1999 invigdes bondgården, där du hittar för Lettland typiska djur
Den 25 maj öppnar Tropiska huset sina portar. Tropiska huset i Rigas zoo är hem åt 80 olika djurarter. Här hittar du olika groddjur, reptiler, ryggradslösa djur (insekter, skorpioner, spindlar m.fl.) och nattdjur. Detta är den första stora utställningen i Rigas zoo och särskild imponerande är bladskärarmyrorna.
